More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1775 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
433 aa  872    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.59 
 
 
425 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.96 
 
 
428 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.13 
 
 
423 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.13 
 
 
423 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.61 
 
 
423 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.66 
 
 
423 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.04 
 
 
433 aa  501  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.69 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
427 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
432 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.39 
 
 
421 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.16 
 
 
433 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.66 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.08 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.77 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
425 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 
434 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 
427 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
425 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
424 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.71 
 
 
428 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 
425 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
430 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.78 
 
 
433 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
428 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 
425 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 
425 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
437 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 
427 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 
428 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
425 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.75 
 
 
430 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 
423 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
425 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
425 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 
428 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
434 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.98 
 
 
435 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
430 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
422 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 
429 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.16 
 
 
430 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 
428 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
428 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.47 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.08 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.61 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 
428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
430 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.12 
 
 
423 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
425 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 
425 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
431 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
429 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.66 
 
 
425 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  46.3 
 
 
443 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 
429 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 
422 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
426 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 
429 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
428 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.82 
 
 
433 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
429 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
428 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.19 
 
 
446 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.3 
 
 
430 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
429 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
426 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.41 
 
 
429 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  49.65 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 
431 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  45.14 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
429 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 
419 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.96 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>