More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0555 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 424 aa  858    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.19 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.72 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.14 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.96 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.77 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.38 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.57 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.54 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.72 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.77 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.34 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.77 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.54 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.21 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.54 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.07 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.01 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.34 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.24 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.01 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.07 
 
 		 423 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.3 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.3 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.64 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.3 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 428 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  52.68 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.72 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  52.68 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.68 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.68 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.45 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.21 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.57 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.68 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.44 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.44 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.34 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.69 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.06 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.44 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.87 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 427 aa  428  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.06 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.28 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 		 429 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.28 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.22 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.82 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.64 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.41 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.54 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.38 
 
 		 421 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.81 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 591 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.41 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 430 aa  418  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.54 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.11 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.65 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>