More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1672 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1672  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 410 aa  832    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.561009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1521  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.75 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1570  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.75 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0386  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.64 
 
 		 395 aa  448  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.15 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.39 
 
 		 416 aa  296  6e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.87 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.87 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 		 416 aa  293  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.85 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.2 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.71 
 
 		 414 aa  285  9e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.29 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.63 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.87 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.67 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.38 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.39 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.77 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.1 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.67 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.61 
 
 		 412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 		 424 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.71 
 
 		 433 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.55 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1189  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.1 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000704507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.86 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.18 
 
 		 426 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.94 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.59 
 
 		 422 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.07 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.39 
 
 		 429 aa  262  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.09 
 
 		 415 aa  262  8.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 		 424 aa  262  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.92 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.94 
 
 		 426 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.22 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.99 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.59 
 
 		 425 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.98 
 
 		 426 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.59 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.07 
 
 		 423 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.07 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.32 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.2 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.83 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.08 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.59 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.59 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.59 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.23 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.59 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  38.66 
 
 		 445 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.35 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.35 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.35 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.35 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.63 
 
 		 422 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.5 
 
 		 421 aa  256  6e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.9 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.11 
 
 		 422 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.59 
 
 		 423 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.83 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.59 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.59 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.96 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.84 
 
 		 420 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.98 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.07 
 
 		 423 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.97 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.05 
 
 		 428 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.28 
 
 		 420 aa  252  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.46 
 
 		 427 aa  252  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.87 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.95 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.99 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.68 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.39 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.49 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.54 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.67 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.78 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.02 
 
 		 416 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.78 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.21 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.99 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.41 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.63 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.52 
 
 		 419 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.3 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.13 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  37.86 
 
 		 443 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.31 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.87 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.75 
 
 		 427 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.82 
 
 		 427 aa  246  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.69 
 
 		 429 aa  245  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.63 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.51 
 
 		 430 aa  245  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>