More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0911 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 434 aa  880    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  98.39 
 
 		 434 aa  869    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.87 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.66 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.25 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.45 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  51.42 
 
 		 443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  50.47 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1438  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 		 443 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  51.77 
 
 		 445 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.93 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.07 
 
 		 428 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.16 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.06 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 418 aa  359  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 		 432 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.65 
 
 		 421 aa  356  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 425 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 		 422 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.37 
 
 		 423 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.94 
 
 		 423 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.94 
 
 		 423 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.36 
 
 		 418 aa  352  8.999999999999999e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.57 
 
 		 415 aa  352  1e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.14 
 
 		 419 aa  350  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.38 
 
 		 419 aa  349  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.62 
 
 		 433 aa  348  8e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.34 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 		 414 aa  346  6e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.53 
 
 		 428 aa  346  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.45 
 
 		 433 aa  345  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 		 422 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 		 428 aa  344  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.9 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.31 
 
 		 426 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.14 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.32 
 
 		 429 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 		 423 aa  339  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.31 
 
 		 422 aa  338  9e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.77 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.86 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.9 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.76 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.51 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.26 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.05 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.26 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.05 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 		 423 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 422 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 		 423 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.66 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.59 
 
 		 428 aa  335  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 429 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.05 
 
 		 704 aa  335  1e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.57 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 		 419 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.05 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>