More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_15011 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1438  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.6 
 
 
443 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 
445 aa  893    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  72.71 
 
 
443 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  72.41 
 
 
443 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.74 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.34 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.64 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.51 
 
 
435 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.39 
 
 
438 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.5 
 
 
433 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 
425 aa  359  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.32 
 
 
428 aa  353  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.86 
 
 
433 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 
433 aa  348  8e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.13 
 
 
423 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.13 
 
 
423 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.82 
 
 
423 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.95 
 
 
426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.37 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.63 
 
 
429 aa  340  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.33 
 
 
422 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.04 
 
 
421 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.9 
 
 
419 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.71 
 
 
423 aa  336  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
424 aa  334  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.57 
 
 
415 aa  333  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
426 aa  331  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.38 
 
 
416 aa  330  2e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  41 
 
 
430 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 
430 aa  330  4e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.79 
 
 
424 aa  329  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.95 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.33 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  40.8 
 
 
809 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.67 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.09 
 
 
421 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 
420 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.76 
 
 
417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.33 
 
 
430 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.1 
 
 
429 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.57 
 
 
426 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.62 
 
 
425 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.52 
 
 
428 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.1 
 
 
429 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.62 
 
 
428 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.39 
 
 
421 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.9 
 
 
431 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.57 
 
 
429 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.75 
 
 
427 aa  322  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.24 
 
 
423 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.38 
 
 
432 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.98 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.01 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.05 
 
 
424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.72 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.94 
 
 
423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.48 
 
 
423 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  42.59 
 
 
795 aa  320  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.48 
 
 
449 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.58 
 
 
427 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.48 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.72 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.19 
 
 
418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 
416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.24 
 
 
414 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 
426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.72 
 
 
704 aa  320  5e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.9 
 
 
419 aa  320  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.44 
 
 
428 aa  319  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
430 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.38 
 
 
427 aa  319  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.24 
 
 
423 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.57 
 
 
431 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.24 
 
 
423 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.15 
 
 
424 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.12 
 
 
428 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.57 
 
 
431 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.76 
 
 
416 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 
428 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.76 
 
 
416 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.62 
 
 
422 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.01 
 
 
423 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.66 
 
 
429 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
415 aa  318  2e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.86 
 
 
430 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 
437 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.48 
 
 
423 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.15 
 
 
430 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.01 
 
 
426 aa  316  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.72 
 
 
428 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.19 
 
 
429 aa  316  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.52 
 
 
423 aa  316  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 
430 aa  316  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.64 
 
 
423 aa  315  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.24 
 
 
423 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>