More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0551 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
435 aa  877    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  77.14 
 
 
435 aa  674    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.04 
 
 
438 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.31 
 
 
446 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.45 
 
 
434 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.45 
 
 
434 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  49.54 
 
 
443 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  48.51 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  50.35 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1438  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.51 
 
 
443 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.53 
 
 
433 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.01 
 
 
433 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 
425 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.29 
 
 
428 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.48 
 
 
430 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 
421 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 
423 aa  368  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.28 
 
 
418 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.36 
 
 
423 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.36 
 
 
423 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 
430 aa  365  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.39 
 
 
423 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.34 
 
 
424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.56 
 
 
429 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 
433 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.91 
 
 
419 aa  358  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.49 
 
 
422 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 
421 aa  355  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.51 
 
 
422 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.63 
 
 
449 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.82 
 
 
429 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.27 
 
 
422 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
425 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 
426 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.49 
 
 
425 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 
429 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.04 
 
 
704 aa  350  4e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 
428 aa  350  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
430 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.21 
 
 
423 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.37 
 
 
425 aa  349  6e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.51 
 
 
426 aa  349  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.64 
 
 
423 aa  349  7e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 
427 aa  348  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.05 
 
 
428 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.41 
 
 
424 aa  348  1e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.05 
 
 
428 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 
426 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.46 
 
 
428 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.34 
 
 
433 aa  346  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 
426 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.8 
 
 
418 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
419 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
432 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 
427 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 
432 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 
421 aa  343  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 
414 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  45.97 
 
 
430 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 
423 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 
426 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 
432 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.11 
 
 
421 aa  341  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 
423 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 
420 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  45.02 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.74 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.9 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.93 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 
423 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 
423 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.03 
 
 
427 aa  339  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 
427 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.14 
 
 
430 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 
591 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 
425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.02 
 
 
425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  43.16 
 
 
809 aa  338  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.11 
 
 
427 aa  338  8e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 
425 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.11 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.69 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.43 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.59 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.26 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.74 
 
 
423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.74 
 
 
423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 
427 aa  335  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
422 aa  336  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 
422 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.02 
 
 
423 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
428 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
429 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 
430 aa  333  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 
435 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>