More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1532 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
423 aa  848    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  72.36 
 
 
413 aa  590  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  52 
 
 
425 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 
422 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.01 
 
 
425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.49 
 
 
419 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.21 
 
 
419 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
423 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 
423 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
423 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 
423 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 
424 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 
423 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.12 
 
 
425 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 
433 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 
423 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 
423 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
430 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
430 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
456 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.89 
 
 
419 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.2 
 
 
419 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 
433 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
423 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 
429 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
417 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.64 
 
 
428 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.15 
 
 
416 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.71 
 
 
433 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 
423 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 
423 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 
423 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 
424 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 
424 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 
423 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 
423 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.42 
 
 
429 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 
429 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  48.47 
 
 
430 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.94 
 
 
430 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 
427 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 
437 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 
423 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
427 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 
427 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.82 
 
 
423 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 
423 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 
425 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 
426 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.26 
 
 
430 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.82 
 
 
423 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.94 
 
 
433 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 
416 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.47 
 
 
426 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.1 
 
 
428 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.03 
 
 
428 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.23 
 
 
425 aa  364  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
427 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 
422 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 
421 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 
423 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 
423 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.1 
 
 
423 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.32 
 
 
423 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 
425 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 
424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 
423 aa  362  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.69 
 
 
427 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 
425 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.87 
 
 
423 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.17 
 
 
426 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 
426 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 
422 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 
426 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 
591 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.17 
 
 
426 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 
432 aa  359  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
432 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
425 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.33 
 
 
427 aa  359  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
427 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 
428 aa  359  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
425 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 
422 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
432 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 
426 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 
422 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.12 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.98 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.41 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 
425 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 
422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>