More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0678 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 416 aa  827    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  97.36 
 
 		 416 aa  811    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1913  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.07 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.93 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.57 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.28 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 		 419 aa  401  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.12 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.47 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.57 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.87 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.6 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.07 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.13 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.32 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.67 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.6 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.19 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.19 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  45.11 
 
 		 809 aa  385  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.19 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.19 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.19 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.19 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.19 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.91 
 
 		 422 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.83 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.08 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.76 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.19 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.93 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.52 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.71 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.08 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.88 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.71 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.23 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.23 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.99 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  44.37 
 
 		 802 aa  376  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.15 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.78 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.08 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.87 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.93 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.23 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.09 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.99 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.03 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.23 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.52 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.23 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.94 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  45 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>