More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1774 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 428 aa  871    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.1 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.24 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.89 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.36 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.55 
 
 		 425 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 423 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.77 
 
 		 424 aa  431  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 423 aa  431  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.82 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 419 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.55 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 		 591 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.94 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.06 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.06 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.83 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.62 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 		 432 aa  411  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  50.82 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.92 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.59 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.69 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  48.83 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.49 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.36 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.9 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.84 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.3 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.59 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.47 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.17 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.43 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.45 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>