More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0312 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 426 aa  840    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.42 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.29 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.86 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.87 
 
 		 422 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.37 
 
 		 421 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.01 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.08 
 
 		 591 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.69 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.29 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.58 
 
 		 424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.31 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.5 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.45 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.98 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.31 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.79 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.12 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.18 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.63 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  54.78 
 
 		 430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.01 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.01 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.72 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.66 
 
 		 456 aa  441  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.3 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.08 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.77 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.41 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.94 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.94 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.07 
 
 		 425 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.19 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.23 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.19 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.71 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.04 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.16 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.27 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.94 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.94 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.48 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.98 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.77 
 
 		 429 aa  435  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 423 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.71 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.61 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  53.99 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  53.99 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.46 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.07 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.07 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.88 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.19 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.46 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.76 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.24 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.36 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.36 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.48 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.61 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.5 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.76 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.52 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.24 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.44 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.48 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.52 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.24 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.78 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.02 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.08 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.55 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.26 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.73 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.88 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.24 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.24 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.82 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.59 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.01 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.25 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.93 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 421 aa  425  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.41 
 
 		 430 aa  425  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.25 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.25 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.83 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.36 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>