More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4582 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  73.77 
 
 		 430 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  93.94 
 
 		 429 aa  827    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  93.24 
 
 		 429 aa  822    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.77 
 
 		 431 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  79.58 
 
 		 428 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  99.3 
 
 		 429 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  99.3 
 
 		 429 aa  869    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.83 
 
 		 431 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  93.94 
 
 		 429 aa  828    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  80.75 
 
 		 427 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  79.67 
 
 		 428 aa  710    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  76.87 
 
 		 429 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  79.67 
 
 		 428 aa  712    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  93.24 
 
 		 429 aa  822    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  99.77 
 
 		 429 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 429 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.77 
 
 		 428 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.53 
 
 		 431 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.07 
 
 		 430 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  79.34 
 
 		 428 aa  705    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  93.94 
 
 		 429 aa  827    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  99.07 
 
 		 429 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  79.11 
 
 		 428 aa  702    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.43 
 
 		 429 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  76.4 
 
 		 429 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  92.77 
 
 		 429 aa  822    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  75 
 
 		 431 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.83 
 
 		 427 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  93.94 
 
 		 429 aa  828    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  82.52 
 
 		 429 aa  730    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.39 
 
 		 432 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  93.46 
 
 		 430 aa  819    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.77 
 
 		 430 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  76.4 
 
 		 429 aa  678    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  93.94 
 
 		 429 aa  828    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  82.01 
 
 		 428 aa  732    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  93.71 
 
 		 429 aa  827    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.3 
 
 		 429 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  72.2 
 
 		 430 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.36 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.59 
 
 		 431 aa  627  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.43 
 
 		 430 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.43 
 
 		 429 aa  624  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.43 
 
 		 429 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.79 
 
 		 432 aa  622  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.3 
 
 		 426 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.09 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.93 
 
 		 430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.86 
 
 		 428 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.28 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.13 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.36 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.13 
 
 		 432 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.13 
 
 		 432 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.9 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.9 
 
 		 432 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.9 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.67 
 
 		 432 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.44 
 
 		 432 aa  591  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.52 
 
 		 432 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.82 
 
 		 430 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.25 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.52 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.21 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.76 
 
 		 429 aa  584  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.29 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.78 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3413  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.75 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.872928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0443  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.29 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.19 
 
 		 429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.94 
 
 		 437 aa  558  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.64 
 
 		 430 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.73 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.64 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.24 
 
 		 422 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.34 
 
 		 426 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.99 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.55 
 
 		 422 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.49 
 
 		 425 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0036  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 		 424 aa  531  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.413084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.45 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.21 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.12 
 
 		 430 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.24 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.79 
 
 		 427 aa  527  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  62 
 
 		 428 aa  528  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.36 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.21 
 
 		 426 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  62 
 
 		 428 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.77 
 
 		 432 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.84 
 
 		 426 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.07 
 
 		 426 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.84 
 
 		 426 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.89 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1061  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.09 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.89 
 
 		 425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.66 
 
 		 425 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.42 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.68 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.84 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>