More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0532 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 426 aa  856    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.28 
 
 		 435 aa  577  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.11 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.21 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.49 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.81 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.55 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.41 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.41 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.77 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  50.12 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  47.78 
 
 		 809 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.41 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.71 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 422 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.19 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  48 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.02 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.12 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.85 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.85 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.76 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.53 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.37 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.85 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.12 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.59 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  48.83 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.2 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.79 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.37 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.53 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.59 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.27 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>