More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1653 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
427 aa  861    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.66 
 
 
426 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.85 
 
 
435 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.45 
 
 
427 aa  584  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.11 
 
 
426 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.11 
 
 
428 aa  559  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.17 
 
 
427 aa  551  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.5 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.73 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 
423 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
429 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.84 
 
 
433 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
429 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
423 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  49.65 
 
 
429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
429 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 
419 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 
423 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  45.35 
 
 
809 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 
427 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 
425 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.19 
 
 
430 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 
429 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.19 
 
 
431 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.56 
 
 
425 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
422 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.73 
 
 
431 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.46 
 
 
426 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.37 
 
 
424 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.19 
 
 
431 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.31 
 
 
428 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
429 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
429 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.2 
 
 
433 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.27 
 
 
427 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 
426 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.84 
 
 
429 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 
429 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.96 
 
 
437 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.73 
 
 
426 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
422 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 
429 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 
430 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
428 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.96 
 
 
424 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 
425 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.02 
 
 
433 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.92 
 
 
428 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.54 
 
 
423 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 
422 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.56 
 
 
425 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.67 
 
 
428 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.69 
 
 
428 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 
422 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.08 
 
 
430 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
423 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
429 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
423 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 
425 aa  382  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 
431 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 
422 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 
430 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 
591 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.73 
 
 
427 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 
419 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
432 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 
432 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.81 
 
 
428 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
432 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
423 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.08 
 
 
427 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 
431 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  44.24 
 
 
795 aa  376  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.99 
 
 
425 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.07 
 
 
433 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 
428 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.02 
 
 
430 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.96 
 
 
432 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.27 
 
 
430 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.9 
 
 
429 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.37 
 
 
430 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 
432 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
432 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
429 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.67 
 
 
431 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 
432 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 
432 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
426 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.78 
 
 
422 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3413  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 
433 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.872928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>