More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78660 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  54.58 
 
 		 809 aa  878    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  54.59 
 
 		 802 aa  844    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  100 
 
 		 795 aa  1610    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.55 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.7 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 		 435 aa  389  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.13 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  57.23 
 
 		 1237 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.21 
 
 		 428 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.81 
 
 		 359 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.81 
 
 		 359 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 425 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.03 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 427 aa  376  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.03 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.27 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 		 426 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.91 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.7 
 
 		 357 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.14 
 
 		 437 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.87 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.23 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.56 
 
 		 363 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.57 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.49 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.58 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.66 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 		 423 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.56 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.08 
 
 		 348 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.93 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  45.92 
 
 		 430 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.08 
 
 		 348 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.13 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 		 428 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.95 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.85 
 
 		 426 aa  366  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 427 aa  366  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.18 
 
 		 357 aa  365  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.95 
 
 		 429 aa  365  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.29 
 
 		 428 aa  365  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.17 
 
 		 361 aa  365  2e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 432 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 428 aa  364  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.49 
 
 		 348 aa  364  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.85 
 
 		 357 aa  364  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.7 
 
 		 427 aa  364  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.98 
 
 		 346 aa  364  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.16 
 
 		 432 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.44 
 
 		 428 aa  363  5.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.05 
 
 		 423 aa  363  5.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.83 
 
 		 432 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.85 
 
 		 437 aa  363  7.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 423 aa  363  9e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.85 
 
 		 424 aa  363  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.88 
 
 		 422 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.52 
 
 		 429 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 		 353 aa  362  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 428 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 		 430 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.13 
 
 		 356 aa  361  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 428 aa  361  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 430 aa  361  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.06 
 
 		 433 aa  361  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.6 
 
 		 427 aa  361  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 419 aa  360  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 		 430 aa  360  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.95 
 
 		 427 aa  360  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.94 
 
 		 424 aa  360  6e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.57 
 
 		 432 aa  360  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.75 
 
 		 431 aa  360  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.8 
 
 		 432 aa  360  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 433 aa  360  8e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 		 429 aa  360  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.93 
 
 		 428 aa  359  9e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.04 
 
 		 428 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.93 
 
 		 428 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.51 
 
 		 349 aa  359  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.94 
 
 		 424 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.57 
 
 		 432 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.79 
 
 		 426 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.57 
 
 		 432 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 421 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.04 
 
 		 428 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.11 
 
 		 426 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39441  predicted protein  45.52 
 
 		 477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.178853  normal  0.0538587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 		 430 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.96 
 
 		 357 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>