More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39441 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_39441  predicted protein  100 
 
 
477 aa  947    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.178853  normal  0.0538587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.74 
 
 
429 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.47 
 
 
427 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.64 
 
 
426 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.04 
 
 
427 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.47 
 
 
427 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.54 
 
 
423 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.91 
 
 
424 aa  502  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.58 
 
 
426 aa  501  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.31 
 
 
427 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.14 
 
 
442 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.98 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.14 
 
 
427 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.36 
 
 
426 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.72 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.24 
 
 
427 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.71 
 
 
429 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.95 
 
 
425 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.35 
 
 
429 aa  488  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.67 
 
 
436 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.53 
 
 
429 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.94 
 
 
427 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.4 
 
 
430 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.24 
 
 
428 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.07 
 
 
428 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.64 
 
 
428 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.88 
 
 
428 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.24 
 
 
429 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.41 
 
 
428 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.61 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  55.74 
 
 
430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.37 
 
 
428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.74 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.16 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.84 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.37 
 
 
428 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.21 
 
 
427 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.84 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.61 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  55.84 
 
 
429 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.61 
 
 
429 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  56.74 
 
 
430 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.61 
 
 
429 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.37 
 
 
429 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.37 
 
 
430 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.27 
 
 
429 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.14 
 
 
429 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.78 
 
 
433 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  55.84 
 
 
429 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.84 
 
 
429 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.84 
 
 
429 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.61 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.72 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.37 
 
 
420 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.63 
 
 
424 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.7 
 
 
432 aa  461  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.16 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.91 
 
 
429 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.15 
 
 
449 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.69 
 
 
423 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.91 
 
 
429 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.91 
 
 
429 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.74 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.21 
 
 
429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.72 
 
 
420 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.42 
 
 
456 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.31 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.05 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.57 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.4 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.89 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.71 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.44 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 
423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.74 
 
 
431 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 
429 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 
430 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.21 
 
 
430 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.93 
 
 
423 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.74 
 
 
431 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.89 
 
 
435 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.72 
 
 
420 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.16 
 
 
423 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.69 
 
 
422 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 
425 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.23 
 
 
423 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.44 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.16 
 
 
428 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.83 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 
423 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.27 
 
 
431 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.1 
 
 
430 aa  435  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.31 
 
 
431 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.5 
 
 
430 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.83 
 
 
432 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.44 
 
 
430 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.3 
 
 
433 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.06 
 
 
432 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.01 
 
 
420 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>