More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1476 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
348 aa  686    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  78.45 
 
 
348 aa  544  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  78.16 
 
 
348 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  78.16 
 
 
348 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  75.57 
 
 
349 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  75.65 
 
 
353 aa  511  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  75.22 
 
 
348 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.84 
 
 
357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.84 
 
 
357 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.14 
 
 
359 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.14 
 
 
359 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.04 
 
 
363 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.1 
 
 
356 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.72 
 
 
357 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.64 
 
 
355 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.42 
 
 
357 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.17 
 
 
357 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.22 
 
 
355 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.89 
 
 
357 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.71 
 
 
355 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.37 
 
 
361 aa  419  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.02 
 
 
388 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.89 
 
 
357 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.17 
 
 
357 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.77 
 
 
356 aa  417  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.92 
 
 
368 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.54 
 
 
357 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.55 
 
 
355 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.84 
 
 
355 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.93 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.75 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.43 
 
 
357 aa  401  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.33 
 
 
363 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60 
 
 
353 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.98 
 
 
355 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.92 
 
 
352 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.1 
 
 
356 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.11 
 
 
345 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.97 
 
 
345 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.34 
 
 
363 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
369 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  54.07 
 
 
802 aa  377  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.43 
 
 
347 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.25 
 
 
346 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.37 
 
 
354 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.82 
 
 
346 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.09 
 
 
345 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.36 
 
 
358 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.1 
 
 
356 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.9 
 
 
368 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.73 
 
 
346 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.28 
 
 
358 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.02 
 
 
368 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.76 
 
 
345 aa  371  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.12 
 
 
345 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.6 
 
 
346 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
345 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.81 
 
 
349 aa  368  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.43 
 
 
350 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.99 
 
 
345 aa  368  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.13 
 
 
350 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.22 
 
 
345 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  56 
 
 
1237 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
350 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.57 
 
 
352 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.52 
 
 
347 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.22 
 
 
347 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
350 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.23 
 
 
349 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.53 
 
 
341 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.57 
 
 
345 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.46 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.16 
 
 
345 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.22 
 
 
347 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.94 
 
 
346 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  54.49 
 
 
795 aa  364  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.77 
 
 
366 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.86 
 
 
345 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.65 
 
 
363 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.86 
 
 
345 aa  363  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  55.86 
 
 
345 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.57 
 
 
346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.08 
 
 
346 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.87 
 
 
348 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.95 
 
 
353 aa  360  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.65 
 
 
359 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.46 
 
 
345 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.46 
 
 
345 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.16 
 
 
345 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.46 
 
 
345 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.79 
 
 
346 aa  359  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.16 
 
 
345 aa  358  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>