More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2167 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
388 aa  777    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.52 
 
 
357 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65 
 
 
355 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.12 
 
 
357 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.93 
 
 
357 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.5 
 
 
348 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.31 
 
 
355 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.29 
 
 
363 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.85 
 
 
359 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.33 
 
 
361 aa  421  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.8 
 
 
348 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.18 
 
 
368 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.85 
 
 
359 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.36 
 
 
346 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.78 
 
 
357 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.11 
 
 
357 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.16 
 
 
349 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.65 
 
 
357 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.34 
 
 
357 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.68 
 
 
356 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
348 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.55 
 
 
363 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.34 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.86 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.32 
 
 
357 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.91 
 
 
355 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.2 
 
 
356 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.75 
 
 
348 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.5 
 
 
366 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.1 
 
 
368 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  55.34 
 
 
802 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.61 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.54 
 
 
353 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.32 
 
 
359 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.31 
 
 
355 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.02 
 
 
353 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.31 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.66 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.57 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.39 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
345 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.27 
 
 
345 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.83 
 
 
356 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.86 
 
 
345 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  56.86 
 
 
345 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.27 
 
 
345 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.27 
 
 
350 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.01 
 
 
346 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.86 
 
 
345 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.27 
 
 
345 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.27 
 
 
350 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.13 
 
 
363 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.86 
 
 
345 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.18 
 
 
346 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.12 
 
 
346 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.83 
 
 
347 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.86 
 
 
345 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.86 
 
 
345 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.17 
 
 
356 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.27 
 
 
345 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.69 
 
 
341 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
345 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.86 
 
 
345 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.09 
 
 
347 aa  391  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.68 
 
 
352 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.86 
 
 
345 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.86 
 
 
345 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.77 
 
 
345 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.09 
 
 
347 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.2 
 
 
346 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.56 
 
 
346 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.69 
 
 
359 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.23 
 
 
345 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.8 
 
 
347 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.57 
 
 
345 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.93 
 
 
352 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.52 
 
 
346 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.23 
 
 
369 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.65 
 
 
346 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.77 
 
 
345 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.64 
 
 
345 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
345 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.06 
 
 
355 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.64 
 
 
345 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.61 
 
 
345 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
345 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.04 
 
 
354 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.06 
 
 
358 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.72 
 
 
345 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.97 
 
 
345 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.94 
 
 
363 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.84 
 
 
345 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.23 
 
 
346 aa  378  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.26 
 
 
348 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.78 
 
 
345 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.31 
 
 
350 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.33 
 
 
345 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>