More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3852 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
357 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  87.08 
 
 
357 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  87.32 
 
 
357 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  86.8 
 
 
357 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  85.11 
 
 
357 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  85.71 
 
 
356 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  82.07 
 
 
357 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  70.74 
 
 
357 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  70.86 
 
 
357 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  69.58 
 
 
368 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.84 
 
 
355 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.95 
 
 
359 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  69.23 
 
 
363 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.95 
 
 
359 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  66.57 
 
 
357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.84 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  70.74 
 
 
357 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.86 
 
 
355 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  69.71 
 
 
356 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.67 
 
 
355 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  67.32 
 
 
353 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.57 
 
 
355 aa  454  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.57 
 
 
355 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.51 
 
 
359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.29 
 
 
361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.72 
 
 
348 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.59 
 
 
348 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.02 
 
 
348 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.08 
 
 
363 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.41 
 
 
349 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.59 
 
 
348 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.04 
 
 
353 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.86 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.65 
 
 
346 aa  414  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.46 
 
 
348 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  57.61 
 
 
802 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  58.1 
 
 
1237 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.39 
 
 
368 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.32 
 
 
356 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.68 
 
 
353 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.53 
 
 
341 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.43 
 
 
366 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.05 
 
 
363 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  53.91 
 
 
809 aa  365  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.55 
 
 
346 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.89 
 
 
368 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
358 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.32 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  53.25 
 
 
795 aa  357  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.18 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.79 
 
 
356 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.78 
 
 
345 aa  352  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.39 
 
 
348 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.49 
 
 
350 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.69 
 
 
346 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.64 
 
 
350 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.49 
 
 
350 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.37 
 
 
349 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
351 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.43 
 
 
346 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.6 
 
 
379 aa  346  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.68 
 
 
345 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.51 
 
 
348 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.16 
 
 
351 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.16 
 
 
351 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
351 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.16 
 
 
351 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.16 
 
 
351 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.16 
 
 
351 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.51 
 
 
350 aa  344  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.16 
 
 
351 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.75 
 
 
348 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.33 
 
 
350 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.06 
 
 
350 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.78 
 
 
346 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.75 
 
 
351 aa  342  5.999999999999999e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.56 
 
 
369 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.86 
 
 
349 aa  341  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
342 aa  341  1e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1970  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.26 
 
 
352 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.023666 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.56 
 
 
351 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.79 
 
 
348 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48 
 
 
363 aa  340  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.08 
 
 
348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.44 
 
 
342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3848  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375893  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.78 
 
 
336 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.71 
 
 
350 aa  339  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.6 
 
 
345 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.42 
 
 
345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.57 
 
 
349 aa  338  8e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.6 
 
 
345 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.47 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.38 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.79 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0655  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.46 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0202  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.58 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0422268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>