More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0235 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
363 aa  714    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.22 
 
 
357 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.82 
 
 
357 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.13 
 
 
388 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.45 
 
 
349 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  69.55 
 
 
356 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.34 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.69 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.01 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.07 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.77 
 
 
359 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.23 
 
 
348 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.57 
 
 
348 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.57 
 
 
348 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.77 
 
 
359 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.78 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.57 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.53 
 
 
363 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.19 
 
 
357 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.91 
 
 
361 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.47 
 
 
355 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.05 
 
 
357 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.61 
 
 
357 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.15 
 
 
355 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.05 
 
 
357 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.01 
 
 
357 aa  388  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.15 
 
 
355 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.47 
 
 
348 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.75 
 
 
357 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.18 
 
 
341 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.29 
 
 
368 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.05 
 
 
356 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.31 
 
 
363 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.69 
 
 
357 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.17 
 
 
359 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.26 
 
 
356 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.29 
 
 
346 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.51 
 
 
356 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.24 
 
 
355 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.98 
 
 
352 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.26 
 
 
345 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.67 
 
 
347 aa  368  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.97 
 
 
346 aa  363  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
368 aa  363  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.18 
 
 
350 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.01 
 
 
358 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.2 
 
 
350 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.61 
 
 
366 aa  359  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.05 
 
 
379 aa  359  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.51 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  52.72 
 
 
802 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.16 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.54 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.39 
 
 
348 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.4 
 
 
352 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.85 
 
 
350 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.21 
 
 
352 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.53 
 
 
359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  54.03 
 
 
1237 aa  352  4e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.39 
 
 
350 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.51 
 
 
363 aa  351  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
345 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.8 
 
 
352 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.01 
 
 
349 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.48 
 
 
410 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.22 
 
 
349 aa  349  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.7 
 
 
353 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
351 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.1 
 
 
346 aa  348  7e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.25 
 
 
350 aa  348  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.95 
 
 
345 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.64 
 
 
355 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.51 
 
 
352 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.51 
 
 
352 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.51 
 
 
352 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.79 
 
 
346 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.61 
 
 
368 aa  346  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  50.87 
 
 
795 aa  346  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.76 
 
 
347 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.76 
 
 
347 aa  346  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.92 
 
 
349 aa  346  4e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.5 
 
 
354 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.76 
 
 
347 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.19 
 
 
348 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.36 
 
 
352 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.55 
 
 
345 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2487  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.52 
 
 
355 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.54 
 
 
346 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.05 
 
 
345 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.45 
 
 
351 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.02 
 
 
345 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.87 
 
 
348 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.96 
 
 
345 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>