More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2545 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
341 aa  681    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.69 
 
 
388 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.8 
 
 
363 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.31 
 
 
357 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.31 
 
 
346 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.49 
 
 
359 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.49 
 
 
359 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.31 
 
 
357 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.88 
 
 
348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.18 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.58 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.3 
 
 
357 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.61 
 
 
353 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.4 
 
 
349 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
361 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.53 
 
 
357 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.31 
 
 
356 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61 
 
 
348 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.18 
 
 
368 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.49 
 
 
355 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.75 
 
 
355 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.51 
 
 
347 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.71 
 
 
353 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.71 
 
 
356 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.53 
 
 
348 aa  388  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.06 
 
 
355 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.88 
 
 
366 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.41 
 
 
357 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.48 
 
 
357 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
357 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.59 
 
 
368 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.19 
 
 
357 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.18 
 
 
363 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.52 
 
 
356 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.18 
 
 
357 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.3 
 
 
368 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.94 
 
 
348 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.7 
 
 
355 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.73 
 
 
345 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
357 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.4 
 
 
355 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.4 
 
 
355 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
359 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.47 
 
 
346 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  53.85 
 
 
795 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  54.9 
 
 
802 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.95 
 
 
359 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.01 
 
 
363 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.53 
 
 
352 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.92 
 
 
345 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.21 
 
 
348 aa  364  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
351 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
351 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
351 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.79 
 
 
345 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.22 
 
 
358 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.38 
 
 
345 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
351 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
351 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.29 
 
 
350 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
351 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2487  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.59 
 
 
355 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.98 
 
 
349 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.81 
 
 
351 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.66 
 
 
369 aa  364  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.71 
 
 
346 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.8 
 
 
352 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.73 
 
 
346 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.51 
 
 
351 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.59 
 
 
346 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.14 
 
 
346 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.79 
 
 
345 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  54.24 
 
 
1237 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.69 
 
 
350 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.27 
 
 
342 aa  360  2e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.19 
 
 
345 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.82 
 
 
346 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.12 
 
 
349 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.19 
 
 
345 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.1 
 
 
349 aa  359  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.64 
 
 
353 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.88 
 
 
345 aa  358  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1720  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.78 
 
 
368 aa  358  6e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.88 
 
 
345 aa  358  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
352 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.96 
 
 
346 aa  358  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.88 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.88 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.88 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.88 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.88 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.88 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  55.88 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.65 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1650  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.78 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.81226  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.03 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.64 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.95 
 
 
352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.73 
 
 
358 aa  355  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.85 
 
 
346 aa  355  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>