More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47067 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  100 
 
 		 1237 aa  2531    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.98 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  46.17 
 
 		 802 aa  385  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  56.43 
 
 		 795 aa  385  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.41 
 
 		 357 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.94 
 
 		 353 aa  382  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.57 
 
 		 363 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.1 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.14 
 
 		 357 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.81 
 
 		 356 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 		 357 aa  380  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.29 
 
 		 363 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.87 
 
 		 435 aa  376  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.47 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.45 
 
 		 388 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.56 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.21 
 
 		 349 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 		 357 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.14 
 
 		 357 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.1 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 		 359 aa  373  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 		 419 aa  373  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 		 359 aa  373  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.2 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.84 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.91 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.91 
 
 		 361 aa  369  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.03 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.8 
 
 		 368 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.2 
 
 		 353 aa  370  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.21 
 
 		 348 aa  366  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 424 aa  365  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.15 
 
 		 357 aa  364  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.33 
 
 		 424 aa  363  9e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  45.37 
 
 		 809 aa  363  1e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.02 
 
 		 355 aa  361  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.41 
 
 		 355 aa  361  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.62 
 
 		 348 aa  360  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  47.38 
 
 		 430 aa  359  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.89 
 
 		 430 aa  359  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.61 
 
 		 429 aa  359  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.27 
 
 		 355 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.61 
 
 		 432 aa  358  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.7 
 
 		 355 aa  356  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.89 
 
 		 355 aa  356  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.95 
 
 		 356 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.58 
 
 		 428 aa  354  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.42 
 
 		 355 aa  354  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.85 
 
 		 419 aa  354  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.28 
 
 		 368 aa  354  7e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.08 
 
 		 431 aa  353  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 423 aa  353  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.98 
 
 		 427 aa  352  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 		 422 aa  350  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 428 aa  350  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 		 428 aa  349  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 428 aa  349  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.49 
 
 		 429 aa  349  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.02 
 
 		 348 aa  348  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 423 aa  348  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.45 
 
 		 348 aa  347  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.21 
 
 		 422 aa  348  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.49 
 
 		 366 aa  348  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.74 
 
 		 436 aa  348  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.08 
 
 		 422 aa  347  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.6 
 
 		 347 aa  347  7e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.8 
 
 		 432 aa  347  7e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.49 
 
 		 359 aa  347  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.02 
 
 		 348 aa  346  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.25 
 
 		 356 aa  347  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.85 
 
 		 422 aa  347  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.47 
 
 		 348 aa  347  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.05 
 
 		 425 aa  346  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.02 
 
 		 423 aa  346  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 423 aa  346  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.03 
 
 		 430 aa  345  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.77 
 
 		 433 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 429 aa  346  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.22 
 
 		 423 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  46 
 
 		 427 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.23 
 
 		 430 aa  344  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 428 aa  344  7e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.8 
 
 		 348 aa  343  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.21 
 
 		 428 aa  343  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 431 aa  343  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 428 aa  343  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.89 
 
 		 427 aa  342  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.32 
 
 		 352 aa  342  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.8 
 
 		 426 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.91 
 
 		 427 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.91 
 
 		 428 aa  342  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 429 aa  341  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.87 
 
 		 346 aa  342  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 430 aa  341  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.79 
 
 		 429 aa  340  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.25 
 
 		 430 aa  340  7e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 		 423 aa  340  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1267  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.91 
 
 		 437 aa  340  8e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00682849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.03 
 
 		 431 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.79 
 
 		 433 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>