More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0171 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
428 aa  870    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.72 
 
 
426 aa  615  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.62 
 
 
435 aa  590  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.57 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.87 
 
 
427 aa  565  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.11 
 
 
427 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.55 
 
 
426 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.21 
 
 
429 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 
429 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 
429 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.74 
 
 
429 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.74 
 
 
429 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 
428 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.04 
 
 
430 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  53.15 
 
 
429 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.68 
 
 
429 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  53.15 
 
 
429 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.27 
 
 
429 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.27 
 
 
429 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 
422 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.27 
 
 
429 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.34 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.21 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
430 aa  415  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.67 
 
 
429 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 
428 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 
428 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 
425 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 
423 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 
425 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.67 
 
 
429 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 
428 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.28 
 
 
429 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 
431 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
429 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 
427 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
432 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
428 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 
425 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 
431 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 
426 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 
430 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 
428 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 
428 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.27 
 
 
427 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 
426 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 
428 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 
428 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 
426 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 
426 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.47 
 
 
428 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 
432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.58 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 
426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.22 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.08 
 
 
426 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.89 
 
 
430 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 
429 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 
431 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.58 
 
 
432 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
433 aa  401  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
426 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  49.65 
 
 
430 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.34 
 
 
430 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.69 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.97 
 
 
433 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
422 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 
430 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
425 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 
423 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.12 
 
 
424 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 
423 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>