More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0036 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 430 aa  869    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.7 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.08 
 
 		 421 aa  552  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.41 
 
 		 704 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.51 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.51 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.79 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.26 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.06 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.41 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  52.07 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 423 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.42 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.96 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 		 427 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.88 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.61 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.85 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.75 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.86 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.51 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  50.68 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.26 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.9 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.59 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  50.93 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 		 428 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.47 
 
 		 423 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.81 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.47 
 
 		 423 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.85 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.47 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  50.93 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.47 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.35 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.46 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.54 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.03 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.83 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.83 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.11 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>