More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1245 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 419 aa  854    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.88 
 
 		 419 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.85 
 
 		 423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.13 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.94 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.94 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.42 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.98 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.46 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.88 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.31 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.94 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.27 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.27 
 
 		 423 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.55 
 
 		 591 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.57 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.27 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.27 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.27 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.51 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.03 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.55 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.27 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.27 
 
 		 423 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.79 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 		 423 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.49 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.69 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.6 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.84 
 
 		 424 aa  418  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.31 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.97 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.23 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.26 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.21 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.72 
 
 		 442 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.81 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.4 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.96 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.96 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.04 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.93 
 
 		 704 aa  405  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.04 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.33 
 
 		 416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.6 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.21 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 		 416 aa  401  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.58 
 
 		 428 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 		 430 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.97 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.3 
 
 		 419 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.45 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  48.25 
 
 		 809 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.19 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.22 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.54 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  46.34 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.34 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>