More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0963 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
353 aa  690    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  74.37 
 
 
355 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.52 
 
 
355 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.43 
 
 
359 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.22 
 
 
355 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.11 
 
 
355 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.22 
 
 
355 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.65 
 
 
355 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.52 
 
 
359 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.52 
 
 
359 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.71 
 
 
361 aa  485  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.48 
 
 
357 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.43 
 
 
363 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.48 
 
 
357 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.08 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.17 
 
 
357 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.32 
 
 
357 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  74.75 
 
 
357 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.14 
 
 
368 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.07 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.13 
 
 
357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.66 
 
 
357 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.48 
 
 
356 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.51 
 
 
357 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.21 
 
 
357 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.32 
 
 
363 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.22 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.5 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.36 
 
 
353 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  60.96 
 
 
802 aa  410  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.5 
 
 
348 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.02 
 
 
388 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.79 
 
 
346 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.32 
 
 
349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.93 
 
 
348 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.01 
 
 
363 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.34 
 
 
366 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.52 
 
 
368 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.32 
 
 
356 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  59.2 
 
 
1237 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.88 
 
 
341 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.12 
 
 
348 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.26 
 
 
356 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.83 
 
 
368 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 
345 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.82 
 
 
348 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.01 
 
 
358 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.96 
 
 
347 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.14 
 
 
348 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.51 
 
 
345 aa  362  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  360  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.1 
 
 
352 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.62 
 
 
359 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.57 
 
 
369 aa  360  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.04 
 
 
348 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.37 
 
 
346 aa  359  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.41 
 
 
352 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.91 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.12 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.71 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.33 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.96 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.33 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.6 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.87 
 
 
350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.25 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.62 
 
 
345 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  52.62 
 
 
345 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
350 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  354  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.03 
 
 
347 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  51.64 
 
 
795 aa  353  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.33 
 
 
345 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.03 
 
 
347 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.01 
 
 
353 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.29 
 
 
350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.03 
 
 
347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.59 
 
 
353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  54.47 
 
 
809 aa  352  5e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
342 aa  352  5e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.3 
 
 
345 aa  352  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.24 
 
 
352 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.92 
 
 
346 aa  352  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.32 
 
 
345 aa  351  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.62 
 
 
345 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.25 
 
 
346 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.47 
 
 
349 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.71 
 
 
345 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.71 
 
 
345 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.35 
 
 
348 aa  349  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
346 aa  349  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>