More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1889 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
353 aa  689    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  77.14 
 
 
349 aa  524  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  77.1 
 
 
348 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  77.39 
 
 
348 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  75.65 
 
 
348 aa  511  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  76.52 
 
 
348 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  75 
 
 
348 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  65.8 
 
 
357 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.71 
 
 
357 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.71 
 
 
357 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.46 
 
 
363 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.96 
 
 
356 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.46 
 
 
359 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.46 
 
 
359 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.04 
 
 
357 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.32 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.45 
 
 
361 aa  411  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.64 
 
 
355 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.51 
 
 
355 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.47 
 
 
357 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.93 
 
 
368 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.86 
 
 
357 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.75 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.31 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.58 
 
 
355 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.75 
 
 
356 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.54 
 
 
388 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.48 
 
 
353 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.89 
 
 
357 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.16 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.18 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.87 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.11 
 
 
363 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.32 
 
 
359 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.14 
 
 
355 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 
345 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.61 
 
 
341 aa  381  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.69 
 
 
363 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  58.64 
 
 
1237 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  54.11 
 
 
802 aa  377  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.11 
 
 
352 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.26 
 
 
350 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.52 
 
 
350 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.81 
 
 
358 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.56 
 
 
356 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.38 
 
 
369 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.96 
 
 
346 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.29 
 
 
346 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.8 
 
 
350 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.49 
 
 
345 aa  368  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.76 
 
 
352 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.36 
 
 
379 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.29 
 
 
346 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.74 
 
 
349 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.06 
 
 
356 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.1 
 
 
347 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.85 
 
 
366 aa  362  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.87 
 
 
349 aa  362  6e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.61 
 
 
348 aa  362  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.61 
 
 
348 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  52.91 
 
 
795 aa  362  7.0000000000000005e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.46 
 
 
363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.6 
 
 
345 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.15 
 
 
349 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.2 
 
 
346 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.14 
 
 
368 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.73 
 
 
358 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.18 
 
 
350 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.71 
 
 
342 aa  359  4e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.88 
 
 
355 aa  359  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534892  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.51 
 
 
342 aa  358  7e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.46 
 
 
345 aa  358  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.68 
 
 
346 aa  358  8e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.38 
 
 
346 aa  358  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.33 
 
 
351 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.56 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.81 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.87 
 
 
345 aa  355  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.75 
 
 
351 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.63 
 
 
359 aa  355  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3848  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.04 
 
 
351 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375893  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.44 
 
 
351 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.34 
 
 
345 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.74 
 
 
351 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.22 
 
 
347 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.14 
 
 
351 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.22 
 
 
347 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.22 
 
 
347 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.03 
 
 
352 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.8 
 
 
354 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.88 
 
 
345 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.12 
 
 
349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.429765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>