More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3467 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 423 aa  865    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.85 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.22 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.44 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.52 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.76 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.76 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.54 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.76 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.76 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.52 
 
 		 423 aa  431  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.04 
 
 		 423 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.76 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.96 
 
 		 423 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.52 
 
 		 423 aa  431  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.72 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.76 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.39 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.28 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.96 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.72 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.2 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.66 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.84 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.48 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.37 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 591 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.04 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.96 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.44 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.69 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.88 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.04 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.36 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1913  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.85 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.81 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.08 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.67 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.96 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.67 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.57 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.1 
 
 		 704 aa  390  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.95 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  46.19 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.56 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.52 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.38 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.89 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  47.87 
 
 		 809 aa  383  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.32 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.12 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  46.54 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.5 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  45 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.87 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.71 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.19 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.05 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.43 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.03 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  46.85 
 
 		 802 aa  378  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.13 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  46.01 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.41 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.41 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.49 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>