More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1041 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 424 aa  854    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.98 
 
 		 427 aa  611  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.61 
 
 		 423 aa  595  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0267  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.85 
 
 		 424 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  60 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.53 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.53 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.42 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.47 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.79 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.09 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  48.14 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.14 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.05 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.91 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.62 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.99 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.09 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  48.14 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.81 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.81 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.79 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.09 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.51 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.85 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.51 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.51 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  44.47 
 
 		 809 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.4 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.92 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.73 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.51 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.92 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.14 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.95 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.88 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.86 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.62 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.11 
 
 		 432 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 		 422 aa  362  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  44.99 
 
 		 430 aa  362  8e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.6 
 
 		 433 aa  362  9e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.14 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 432 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.32 
 
 		 427 aa  362  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.94 
 
 		 427 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.14 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.85 
 
 		 428 aa  360  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.72 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  45.94 
 
 		 795 aa  360  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.53 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 426 aa  359  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 431 aa  359  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.24 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.96 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.12 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 		 430 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.53 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.79 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>