More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3601 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 429 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  70.4 
 
 		 428 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.41 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.53 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.49 
 
 		 423 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0267  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.41 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.74 
 
 		 427 aa  481  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.34 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.84 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.7 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.24 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.7 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.12 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.12 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.12 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 432 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.65 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.88 
 
 		 428 aa  362  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  42.99 
 
 		 809 aa  362  7.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.09 
 
 		 429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.74 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.1 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 430 aa  360  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 430 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.65 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.98 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.76 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.19 
 
 		 426 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.65 
 
 		 429 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  43.66 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  43.66 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.43 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.65 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 431 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.05 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.93 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.19 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 430 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.36 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 423 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  42.72 
 
 		 430 aa  349  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 429 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 		 425 aa  348  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.09 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.48 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 		 591 aa  346  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 429 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  44 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.53 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.76 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.09 
 
 		 430 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.94 
 
 		 423 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.94 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 		 456 aa  342  8e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 		 423 aa  342  9e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.18 
 
 		 416 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.34 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.75 
 
 		 425 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 		 423 aa  338  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  41 
 
 		 419 aa  338  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>