More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1427 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 591 aa  1189    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.41 
 
 		 423 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.17 
 
 		 423 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.99 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.96 
 
 		 424 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.34 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.99 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.1 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.34 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.84 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.5 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.39 
 
 		 425 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.67 
 
 		 425 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.44 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.44 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.67 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.67 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.21 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.67 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.44 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.97 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.44 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.67 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.21 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.1 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  56.67 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.44 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  56.67 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.44 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.69 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.88 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.42 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.4 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.23 
 
 		 429 aa  462  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.72 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.33 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.1 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.33 
 
 		 428 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.29 
 
 		 428 aa  458  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.55 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.14 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.29 
 
 		 427 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  54.69 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.37 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.52 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.08 
 
 		 425 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.63 
 
 		 430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.9 
 
 		 430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.84 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.23 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  52.45 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.86 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.29 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.1 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.29 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.29 
 
 		 431 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.08 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.05 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.52 
 
 		 428 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.52 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.58 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.95 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.11 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.1 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.56 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.88 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.82 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.82 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.4 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.72 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.16 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.72 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.01 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.2 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.02 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.26 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3413  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.3 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.872928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.02 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.09 
 
 		 433 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.33 
 
 		 432 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.49 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.58 
 
 		 429 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.26 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.05 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.02 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.29 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.94 
 
 		 422 aa  422  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.33 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 		 428 aa  422  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.16 
 
 		 430 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.35 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>