More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0919 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 423 aa  862    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.61 
 
 		 424 aa  595  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.25 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.34 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0267  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.99 
 
 		 424 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.49 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.21 
 
 		 426 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.55 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.19 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 427 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 		 428 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.59 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  46.23 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 428 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.26 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.41 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.92 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  44.47 
 
 		 809 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  46.05 
 
 		 795 aa  363  2e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 427 aa  362  6e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  45.77 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  45.77 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 		 428 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 430 aa  360  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 429 aa  360  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 429 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.86 
 
 		 449 aa  359  5e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 431 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.1 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 429 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 431 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 419 aa  352  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.67 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 426 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 		 422 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 		 422 aa  348  9e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 		 422 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.13 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.79 
 
 		 427 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.22 
 
 		 424 aa  345  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 		 426 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 432 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.37 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.67 
 
 		 433 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.9 
 
 		 427 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 425 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.13 
 
 		 426 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.95 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 423 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 421 aa  342  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.13 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.82 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 		 591 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>