More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1412 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 422 aa  846    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.63 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.01 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.77 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.92 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.19 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.92 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.97 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.81 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.74 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.72 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.45 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.67 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.92 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.96 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 		 429 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.31 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.16 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.96 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6062  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.27 
 
 		 442 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498795  normal  0.336807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.48 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.92 
 
 		 435 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.97 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.72 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.19 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.48 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.24 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.82 
 
 		 422 aa  460  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1523  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.43 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.67 
 
 		 449 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.87 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3104  phosphoribosylamine--glycine ligase  60 
 
 		 411 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.77 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.77 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.57 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2728  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.82 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0882976  normal  0.135316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.57 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.01 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.1 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.47 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.41 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39441  predicted protein  52.69 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.178853  normal  0.0538587 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  50.47 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.11 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.4 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.53 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  49.77 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.37 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 423 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.34 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.12 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>