More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1347 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
417 aa  818    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.12 
 
 
423 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.16 
 
 
413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.84 
 
 
433 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 
430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 
425 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.91 
 
 
427 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 
425 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.26 
 
 
425 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.24 
 
 
432 aa  325  6e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
429 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.53 
 
 
428 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.14 
 
 
435 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.06 
 
 
429 aa  323  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.93 
 
 
422 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 
424 aa  322  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 
432 aa  322  7e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1523  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.38 
 
 
423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 
430 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 
429 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.8 
 
 
421 aa  319  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.1 
 
 
428 aa  319  7e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 
426 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  43.02 
 
 
802 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.28 
 
 
435 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.32 
 
 
423 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.09 
 
 
418 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 
426 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 
426 aa  315  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 
429 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 
429 aa  315  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.05 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
419 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.1 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.03 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.42 
 
 
417 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 
427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.29 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 
430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  44.21 
 
 
429 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.97 
 
 
429 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 
435 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  44.21 
 
 
429 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 
429 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 
429 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 
427 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.26 
 
 
428 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.2 
 
 
423 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.77 
 
 
423 aa  312  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.44 
 
 
430 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 
429 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.2 
 
 
423 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.24 
 
 
419 aa  311  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.23 
 
 
419 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 
425 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
430 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 
429 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 
428 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
431 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 
422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  42.89 
 
 
430 aa  310  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
431 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 
431 aa  309  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 
430 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.48 
 
 
423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 
431 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  41.22 
 
 
795 aa  309  6.999999999999999e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 
433 aa  308  8e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.02 
 
 
432 aa  308  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.32 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.17 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.13 
 
 
423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.82 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.54 
 
 
427 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 
435 aa  307  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.12 
 
 
427 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 
428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.33 
 
 
434 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
433 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.81 
 
 
434 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.15 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>