More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0949 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  81.29 
 
 
414 aa  682    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
417 aa  846    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.5 
 
 
415 aa  609  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.54 
 
 
417 aa  592  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.03 
 
 
416 aa  542  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.07 
 
 
416 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.07 
 
 
416 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.07 
 
 
416 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.14 
 
 
426 aa  521  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.91 
 
 
424 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.54 
 
 
425 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 
422 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 
425 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.14 
 
 
425 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 
422 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 
422 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
425 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 
425 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 
422 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 
432 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
425 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.48 
 
 
425 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
425 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
425 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
426 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 
425 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
432 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.33 
 
 
427 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 
427 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
425 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
425 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
425 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 
426 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 
426 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 
425 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 
428 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 
426 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 
428 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 
426 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 
428 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.79 
 
 
432 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 
422 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 
427 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 
430 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.83 
 
 
430 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 
426 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 
427 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 
429 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 
428 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 
428 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 
429 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 
429 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.96 
 
 
431 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.48 
 
 
428 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 
426 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.84 
 
 
429 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.92 
 
 
422 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 
433 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 
428 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.78 
 
 
432 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 
430 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.32 
 
 
426 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 
429 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.05 
 
 
428 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 
429 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  43.66 
 
 
809 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 
428 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 
429 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 
429 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 
429 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 
427 aa  364  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.54 
 
 
429 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.79 
 
 
423 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 
428 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 
426 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  45.28 
 
 
430 aa  363  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2459  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 
427 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
427 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 
423 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.92 
 
 
429 aa  361  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.96 
 
 
430 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
427 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
426 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 
431 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.86 
 
 
431 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 
423 aa  359  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 
424 aa  359  6e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.56 
 
 
428 aa  359  6e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.04 
 
 
438 aa  359  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.92 
 
 
430 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.92 
 
 
431 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.94 
 
 
427 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 
423 aa  358  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.84 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 
423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 
422 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.9 
 
 
419 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
424 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>