More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1261 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 415 aa  844    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.46 
 
 		 414 aa  630  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.5 
 
 		 417 aa  609  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.27 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.35 
 
 		 416 aa  528  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.39 
 
 		 416 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.15 
 
 		 416 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.91 
 
 		 416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.67 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.67 
 
 		 426 aa  498  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.99 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  43.06 
 
 		 809 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.56 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 		 429 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 425 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 425 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 425 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 425 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.79 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 		 422 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 425 aa  355  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 422 aa  355  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  42.56 
 
 		 795 aa  355  7.999999999999999e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 		 425 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.57 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.9 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.59 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.93 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 426 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  43.63 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.15 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 428 aa  349  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.36 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.79 
 
 		 449 aa  348  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 428 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  42.23 
 
 		 802 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.16 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.02 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 428 aa  345  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 		 423 aa  345  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 431 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 		 422 aa  342  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.03 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 		 428 aa  342  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.84 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.43 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.92 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.32 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.21 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.47 
 
 		 428 aa  339  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.24 
 
 		 426 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 429 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 		 426 aa  339  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.34 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  43.43 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.63 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.92 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.76 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>