More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0504 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  78.85 
 
 		 416 aa  686    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  78.61 
 
 		 416 aa  683    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 416 aa  842    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  78.61 
 
 		 416 aa  683    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.03 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.18 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.35 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.14 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.62 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.96 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  43.66 
 
 		 809 aa  362  6e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 422 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 		 422 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.21 
 
 		 449 aa  338  7e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.77 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1267  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.39 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00682849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 432 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.78 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.44 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.37 
 
 		 430 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.78 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.78 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  41.67 
 
 		 802 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.13 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  42.38 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.19 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.55 
 
 		 426 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.47 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.34 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.34 
 
 		 428 aa  329  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.41 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.92 
 
 		 425 aa  328  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 425 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.47 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.78 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.35 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.49 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.48 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.09 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.08 
 
 		 429 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.48 
 
 		 416 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.61 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.31 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.52 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.9 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.19 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.19 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  40.6 
 
 		 795 aa  323  3e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.91 
 
 		 432 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.48 
 
 		 416 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.98 
 
 		 427 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.9 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.38 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.66 
 
 		 426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.58 
 
 		 412 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  39.76 
 
 		 430 aa  319  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.65 
 
 		 426 aa  319  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.23 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.05 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.97 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.04 
 
 		 428 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.76 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1570  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.53 
 
 		 419 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.45 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.86 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.57 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.81 
 
 		 423 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.15 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.57 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 		 435 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.05 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.05 
 
 		 423 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.11 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.97 
 
 		 427 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 		 425 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  41 
 
 		 426 aa  315  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 		 427 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.76 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.57 
 
 		 423 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.52 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.25 
 
 		 427 aa  315  8e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>