More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1570 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1570  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 397 aa  791    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1521  phosphoribosylamine--glycine ligase  99.5 
 
 		 397 aa  788    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1672  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.75 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.561009  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0386  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.84 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 416 aa  309  5e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.62 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.62 
 
 		 422 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.77 
 
 		 424 aa  279  6e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.72 
 
 		 413 aa  278  8e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.14 
 
 		 422 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.76 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.13 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.89 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.95 
 
 		 424 aa  275  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.76 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.39 
 
 		 417 aa  272  7e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 		 425 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.57 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.14 
 
 		 425 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  38.12 
 
 		 795 aa  265  7e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.38 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.53 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.44 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.29 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.04 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.14 
 
 		 432 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.07 
 
 		 412 aa  264  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.29 
 
 		 426 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.01 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.57 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.14 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.29 
 
 		 426 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.9 
 
 		 425 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1957  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.99 
 
 		 408 aa  262  8e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 		 425 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 		 425 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.18 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  39.29 
 
 		 809 aa  260  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.38 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.92 
 
 		 429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.81 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.24 
 
 		 428 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.8 
 
 		 415 aa  259  6e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  40 
 
 		 433 aa  259  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.79 
 
 		 426 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.55 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.53 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.7 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.72 
 
 		 426 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.12 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.23 
 
 		 421 aa  254  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.82 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.82 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.05 
 
 		 424 aa  252  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.15 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.24 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.93 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.67 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.9 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.68 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.48 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1189  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.05 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000704507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.65 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.36 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.05 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.44 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.55 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  37.77 
 
 		 1631 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.29 
 
 		 427 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.72 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.44 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  37.44 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.42 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.56 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.76 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.62 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.81 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.94 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.35 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.15 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.25 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1913  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.19 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.72 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.94 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.98 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.3 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>