More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1416 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
413 aa  824    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.08 
 
 
419 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 
419 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 
425 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 
419 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
430 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 
591 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
423 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
422 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 
426 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.77 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.36 
 
 
430 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
423 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 
424 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.01 
 
 
423 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.77 
 
 
423 aa  364  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.77 
 
 
423 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.3 
 
 
425 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.68 
 
 
423 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.68 
 
 
423 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
435 aa  360  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.53 
 
 
423 aa  359  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.28 
 
 
423 aa  359  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.19 
 
 
423 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.57 
 
 
412 aa  359  5e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 
427 aa  359  5e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.53 
 
 
423 aa  358  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.3 
 
 
425 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.1 
 
 
426 aa  358  7e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.01 
 
 
423 aa  358  8e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.04 
 
 
423 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.63 
 
 
704 aa  356  5e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.23 
 
 
423 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.27 
 
 
420 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
428 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 
424 aa  355  8.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.52 
 
 
427 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
425 aa  352  8e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 
423 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
428 aa  351  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.75 
 
 
420 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.51 
 
 
423 aa  350  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.24 
 
 
428 aa  349  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 
423 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.11 
 
 
427 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.86 
 
 
423 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 
429 aa  347  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.89 
 
 
433 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.02 
 
 
424 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.02 
 
 
437 aa  346  4e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.84 
 
 
426 aa  345  6e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.36 
 
 
425 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.2 
 
 
429 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 
423 aa  344  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.69 
 
 
421 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.48 
 
 
433 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.41 
 
 
425 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
432 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.51 
 
 
418 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.71 
 
 
424 aa  341  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 
427 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.54 
 
 
437 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.34 
 
 
421 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.47 
 
 
423 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
422 aa  339  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.61 
 
 
421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.29 
 
 
424 aa  338  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
432 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
429 aa  338  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.17 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.48 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.39 
 
 
414 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.76 
 
 
427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 
426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.35 
 
 
425 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 
425 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.23 
 
 
426 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 
426 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.63 
 
 
436 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.07 
 
 
416 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.23 
 
 
426 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 
425 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.81 
 
 
425 aa  335  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
425 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 
430 aa  333  3e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.77 
 
 
428 aa  333  4e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.14 
 
 
424 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1189  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.87 
 
 
417 aa  333  5e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000704507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.57 
 
 
428 aa  332  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 
425 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.39 
 
 
420 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.43 
 
 
456 aa  332  7.000000000000001e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 
425 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>