More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1957 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1957  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
408 aa  771    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.88 
 
 
429 aa  308  8e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 
446 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.65 
 
 
426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.74 
 
 
420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 
424 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.57 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.34 
 
 
415 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.42 
 
 
424 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 
425 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.15 
 
 
430 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 
429 aa  292  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
430 aa  292  9e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.02 
 
 
436 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.93 
 
 
436 aa  289  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.63 
 
 
417 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 
430 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.3 
 
 
425 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
425 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 
429 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
429 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.72 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 
428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 
427 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.91 
 
 
435 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 
428 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
429 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 
439 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.02 
 
 
422 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.15 
 
 
423 aa  282  7.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.8 
 
 
428 aa  282  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 
429 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
425 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 
422 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.54 
 
 
422 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 
426 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.38 
 
 
427 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
429 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 
424 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 
433 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 
430 aa  280  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 
435 aa  279  5e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.73 
 
 
417 aa  280  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 
427 aa  279  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 
438 aa  279  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.24 
 
 
424 aa  279  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  278  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  278  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.75 
 
 
429 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  41.77 
 
 
430 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.81 
 
 
422 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.45 
 
 
430 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  36.28 
 
 
443 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.67 
 
 
425 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 
427 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 
429 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.37 
 
 
433 aa  277  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.45 
 
 
416 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.27 
 
 
429 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
429 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.36 
 
 
419 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  41.51 
 
 
429 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 
431 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 
430 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
429 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 
431 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 
421 aa  276  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.33 
 
 
704 aa  276  7e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 
427 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 
422 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.62 
 
 
431 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
426 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.86 
 
 
433 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.31 
 
 
425 aa  275  9e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  37.23 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.42 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.32 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.15 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  36.28 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.27 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  45.11 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.04 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.14 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>