More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4370 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  88.33 
 
 		 439 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 436 aa  845    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.95 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.62 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.45 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.42 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.6 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.18 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.45 
 
 		 419 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.07 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.66 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.46 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.22 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.51 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.48 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  57.73 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.89 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.52 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.63 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.63 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.69 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.28 
 
 		 416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.9 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.14 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.9 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.1 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.45 
 
 		 416 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.08 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.55 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.21 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.24 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.81 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.94 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.07 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.67 
 
 		 425 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.71 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 431 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.25 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.9 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.51 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.43 
 
 		 704 aa  349  5e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.2 
 
 		 431 aa  348  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.81 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.84 
 
 		 425 aa  345  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.55 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 		 423 aa  342  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 423 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 423 aa  343  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 423 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 431 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.65 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 428 aa  342  9e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  47 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.61 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.44 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.5 
 
 		 428 aa  339  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.34 
 
 		 431 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.36 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.23 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.34 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.99 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.7 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.26 
 
 		 429 aa  336  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.23 
 
 		 429 aa  336  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 430 aa  335  7e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.17 
 
 		 422 aa  335  7e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.23 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.23 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.65 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>