More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 429 aa  835    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  77.51 
 
 		 419 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  69.78 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.91 
 
 		 422 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.51 
 
 		 422 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.51 
 
 		 422 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  72.51 
 
 		 422 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.78 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.45 
 
 		 430 aa  538  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.64 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  68.57 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.49 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.26 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.05 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.98 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.53 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.22 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.02 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  62.8 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.57 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.44 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.37 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.91 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.27 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.75 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.65 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.79 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.89 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 		 439 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.89 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.91 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.19 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.62 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.38 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.63 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.57 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 424 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  48 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 		 422 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.52 
 
 		 414 aa  348  9e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.48 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.86 
 
 		 704 aa  346  4e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.88 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.19 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 427 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.71 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.71 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 421 aa  339  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 		 429 aa  338  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.68 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.24 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.09 
 
 		 429 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.99 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 		 428 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.96 
 
 		 427 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.4 
 
 		 432 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.85 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.91 
 
 		 426 aa  332  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.86 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.86 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  44.86 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  44.86 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.05 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 		 423 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.63 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.83 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.01 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.08 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.09 
 
 		 428 aa  330  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 		 427 aa  328  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.06 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.06 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.41 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.06 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  46.17 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.03 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 		 418 aa  326  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.82 
 
 		 428 aa  326  6e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.22 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.23 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.88 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.63 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>