More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6145 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 411 aa  807    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.61 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.41 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.56 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.31 
 
 		 422 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.77 
 
 		 419 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.02 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.7 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.55 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.59 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.56 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.9 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.98 
 
 		 417 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.96 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.72 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.96 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.53 
 
 		 429 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  61.44 
 
 		 410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.66 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.32 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.19 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.28 
 
 		 427 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.01 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.18 
 
 		 416 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.21 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.34 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.64 
 
 		 416 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.63 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.6 
 
 		 411 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.53 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.36 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.29 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.97 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.56 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.85 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.86 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.71 
 
 		 704 aa  341  1e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.1 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.17 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 425 aa  333  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.9 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 428 aa  328  7e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.47 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.09 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.12 
 
 		 427 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.67 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.74 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.87 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.83 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.37 
 
 		 430 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.2 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.62 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.2 
 
 		 419 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.2 
 
 		 428 aa  316  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.15 
 
 		 449 aa  316  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.9 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.9 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.32 
 
 		 414 aa  315  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 		 430 aa  315  9e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.19 
 
 		 427 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.04 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.02 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.6 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.02 
 
 		 433 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 420 aa  312  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.34 
 
 		 423 aa  311  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.93 
 
 		 425 aa  308  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.36 
 
 		 425 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.17 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  43 
 
 		 425 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 429 aa  305  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 429 aa  305  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 420 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  44.66 
 
 		 429 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  44.66 
 
 		 429 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 429 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 426 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.22 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.33 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.3 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.42 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.3 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.56 
 
 		 427 aa  302  6.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.19 
 
 		 420 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>