More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05830 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 446 aa  863    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.4 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.17 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.53 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.84 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.93 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.05 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.06 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.63 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.73 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.11 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.56 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.93 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.28 
 
 		 416 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.04 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  55.23 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.14 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.38 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.83 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.59 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.98 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.63 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.57 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.86 
 
 		 411 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.21 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.78 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.83 
 
 		 420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.56 
 
 		 422 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.56 
 
 		 422 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.12 
 
 		 427 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.5 
 
 		 433 aa  358  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.56 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.16 
 
 		 436 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 		 404 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.5 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.71 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.24 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.07 
 
 		 420 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.82 
 
 		 425 aa  327  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.42 
 
 		 704 aa  326  5e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.34 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.22 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.17 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.17 
 
 		 420 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 427 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.06 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.03 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 		 427 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 426 aa  315  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  48 
 
 		 420 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.5 
 
 		 428 aa  312  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.41 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.32 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.63 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.57 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.02 
 
 		 430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.26 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.91 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3104  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.42 
 
 		 411 aa  309  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.49 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.67 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2728  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.12 
 
 		 420 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0882976  normal  0.135316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.44 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.17 
 
 		 420 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.94 
 
 		 420 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  42.89 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.09 
 
 		 423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.33 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.89 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.22 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.53 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.74 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.58 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.79 
 
 		 423 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.79 
 
 		 423 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.02 
 
 		 427 aa  299  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.82 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.17 
 
 		 425 aa  299  9e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.6 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.56 
 
 		 442 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.56 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.67 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.86 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1006  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.283424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.18 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1488  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.76 
 
 		 420 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.89 
 
 		 429 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.34 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.17 
 
 		 430 aa  295  9e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.63 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>