More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1488 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1392  phosphoribosylamine--glycine ligase  98.1 
 
 
420 aa  792    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2467  phosphoribosylamine--glycine ligase  99.05 
 
 
420 aa  800    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0419834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1488  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
420 aa  808    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  82.82 
 
 
420 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.64 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.81 
 
 
423 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.57 
 
 
423 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.81 
 
 
423 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.42 
 
 
425 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.52 
 
 
423 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
429 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.68 
 
 
423 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.76 
 
 
421 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
430 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.05 
 
 
423 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.81 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.52 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.31 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.77 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.1 
 
 
424 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
429 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.98 
 
 
428 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.13 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.83 
 
 
427 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 
419 aa  408  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
429 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  52.61 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.21 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  51.9 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
429 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
431 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  51.9 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
429 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.15 
 
 
426 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.61 
 
 
437 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.37 
 
 
424 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 
419 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
433 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  50.71 
 
 
430 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.66 
 
 
428 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.66 
 
 
428 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
429 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
429 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.39 
 
 
431 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.62 
 
 
424 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.66 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.66 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.61 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.1 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 
429 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.33 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 
430 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 
430 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
430 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.5 
 
 
438 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.96 
 
 
429 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.39 
 
 
428 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.59 
 
 
426 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 
427 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.43 
 
 
591 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.51 
 
 
425 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.65 
 
 
428 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.65 
 
 
428 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.59 
 
 
425 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.62 
 
 
429 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 
432 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.43 
 
 
427 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 
429 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.73 
 
 
427 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 
425 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.37 
 
 
426 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
427 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.89 
 
 
427 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.14 
 
 
422 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
432 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.88 
 
 
435 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
424 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
429 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.13 
 
 
429 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.05 
 
 
424 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.67 
 
 
430 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
425 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.92 
 
 
426 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  55 
 
 
426 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.98 
 
 
425 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.41 
 
 
435 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.29 
 
 
418 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
429 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
429 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
437 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>