More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3175 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 418 aa  829    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  81.1 
 
 		 418 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.83 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.62 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.26 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.57 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.93 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.28 
 
 		 435 aa  378  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1392  phosphoribosylamine--glycine ligase  55 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.43 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.46 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.3 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.96 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 591 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.92 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.72 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.93 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.56 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.81 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.83 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2467  phosphoribosylamine--glycine ligase  55 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0419834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1488  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.24 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 422 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 422 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.34 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1267  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.75 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00682849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.15 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.96 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.61 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.99 
 
 		 704 aa  368  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.8 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.12 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.39 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.93 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.73 
 
 		 421 aa  364  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.77 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 		 423 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.05 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.37 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.23 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.27 
 
 		 419 aa  359  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.46 
 
 		 449 aa  360  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 423 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.79 
 
 		 427 aa  359  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.03 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 		 423 aa  359  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.29 
 
 		 428 aa  358  7e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 		 426 aa  358  8e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>