More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2692 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  81.1 
 
 		 418 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 418 aa  825    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.6 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.14 
 
 		 420 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.83 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.25 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.25 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.26 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.22 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.59 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.36 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.7 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.81 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.71 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.76 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1392  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.21 
 
 		 420 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.34 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.23 
 
 		 704 aa  373  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1488  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.39 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2467  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.98 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0419834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.05 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.92 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.17 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.38 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 591 aa  368  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.88 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.23 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.43 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.2 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.11 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.78 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.89 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.12 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  47.88 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  47.89 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1523  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.18 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.43 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.41 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.63 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.47 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.63 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.03 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 429 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 		 437 aa  362  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.61 
 
 		 423 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>