More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_13941 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
446 aa  912    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.87 
 
 
434 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.4 
 
 
434 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.73 
 
 
438 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.89 
 
 
435 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.31 
 
 
435 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  54.06 
 
 
443 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1438  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.48 
 
 
443 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  52.48 
 
 
443 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  51.52 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.19 
 
 
433 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 
433 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 
425 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.46 
 
 
428 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.89 
 
 
423 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.89 
 
 
423 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 
428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.43 
 
 
423 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.97 
 
 
423 aa  355  8.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 
418 aa  354  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.19 
 
 
418 aa  353  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.44 
 
 
433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
426 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.82 
 
 
419 aa  348  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 
430 aa  348  1e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
426 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.14 
 
 
426 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
421 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.84 
 
 
430 aa  347  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 
425 aa  347  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.44 
 
 
429 aa  346  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
429 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.82 
 
 
425 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.24 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 
426 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
425 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.82 
 
 
425 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
425 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 
422 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.82 
 
 
426 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
425 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 
425 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
425 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
432 aa  339  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.54 
 
 
426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.59 
 
 
426 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.09 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.81 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.41 
 
 
423 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  41.09 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.38 
 
 
421 aa  336  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.59 
 
 
426 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.65 
 
 
433 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.34 
 
 
419 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 
421 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.94 
 
 
591 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
423 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
422 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
432 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
423 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.76 
 
 
423 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
425 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.93 
 
 
435 aa  333  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 
422 aa  333  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
423 aa  333  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.76 
 
 
423 aa  333  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
423 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
423 aa  332  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 
422 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
431 aa  332  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.81 
 
 
429 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.78 
 
 
430 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 
429 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.27 
 
 
424 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
423 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
425 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
423 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.36 
 
 
430 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.59 
 
 
425 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  41.75 
 
 
809 aa  330  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.65 
 
 
420 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 
426 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.22 
 
 
425 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
422 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.57 
 
 
704 aa  330  4e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 
429 aa  329  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.16 
 
 
428 aa  329  7e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>