More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1330 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 421 aa  818    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.79 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.98 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.5 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.96 
 
 		 425 aa  431  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.24 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.95 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.5 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.06 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.12 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.97 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.32 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.79 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.61 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.18 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.68 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.42 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.08 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.84 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.25 
 
 		 420 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.48 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.2 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.05 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.08 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.82 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.96 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.13 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.79 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.3 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.98 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.07 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.67 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.93 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.66 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.26 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6062  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.51 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498795  normal  0.336807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.79 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.62 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.83 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2728  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.83 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0882976  normal  0.135316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.92 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  50.82 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.17 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.34 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  50.82 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.88 
 
 		 419 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 419 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.65 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.55 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.85 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.05 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.55 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.92 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3104  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.02 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.7 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.73 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.92 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.98 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>