More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4342 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 416 aa  805    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.24 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  69.19 
 
 		 417 aa  524  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.55 
 
 		 424 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.9 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.21 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  64.95 
 
 		 410 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.41 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.77 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.62 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.14 
 
 		 438 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.86 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.82 
 
 		 436 aa  471  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.89 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.64 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.72 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.02 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.64 
 
 		 411 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.67 
 
 		 411 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.91 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.52 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.5 
 
 		 420 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.11 
 
 		 419 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.98 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.11 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.97 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.29 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.06 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.29 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.97 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.82 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.03 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.75 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.35 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.63 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.39 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.22 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 433 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.68 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.58 
 
 		 704 aa  358  7e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.98 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.13 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.68 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.68 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.52 
 
 		 423 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 		 428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.6 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.56 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 		 429 aa  349  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.73 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 		 423 aa  349  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.84 
 
 		 433 aa  348  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.11 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.24 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.69 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.71 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.56 
 
 		 427 aa  346  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.3 
 
 		 428 aa  345  7e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 429 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.52 
 
 		 428 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 		 426 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.32 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.37 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1392  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.66 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.03 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.32 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.56 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 425 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.26 
 
 		 423 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.67 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1488  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.08 
 
 		 420 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.03 
 
 		 422 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.41 
 
 		 425 aa  339  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 422 aa  338  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  47.03 
 
 		 430 aa  338  9e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.64 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>