More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10787 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
422 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  82.46 
 
 
422 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  82.23 
 
 
422 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  82.23 
 
 
422 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  79.81 
 
 
427 aa  631  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  78.49 
 
 
430 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  73.46 
 
 
417 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.91 
 
 
429 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  68.01 
 
 
419 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  70.12 
 
 
411 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.9 
 
 
421 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.48 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.99 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.19 
 
 
433 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.45 
 
 
415 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.31 
 
 
411 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.37 
 
 
420 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.14 
 
 
424 aa  431  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.21 
 
 
417 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.99 
 
 
416 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.38 
 
 
436 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.5 
 
 
438 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  59.52 
 
 
410 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.84 
 
 
429 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.88 
 
 
429 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.5 
 
 
446 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.74 
 
 
416 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.84 
 
 
428 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.48 
 
 
436 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.95 
 
 
439 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.01 
 
 
433 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.88 
 
 
420 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.83 
 
 
446 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.46 
 
 
433 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.82 
 
 
416 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.7 
 
 
404 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.33 
 
 
429 aa  329  7e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.02 
 
 
414 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 
424 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.09 
 
 
704 aa  323  4e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.93 
 
 
429 aa  318  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.88 
 
 
419 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 
425 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 
425 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 
422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 
429 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 
431 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.06 
 
 
425 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
430 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  308  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.1 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.07 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.69 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.96 
 
 
423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 
432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.35 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.49 
 
 
423 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
429 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.49 
 
 
423 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 
420 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.75 
 
 
426 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 
426 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.82 
 
 
431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.46 
 
 
429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  42.92 
 
 
429 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.46 
 
 
429 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 
427 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.82 
 
 
430 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
429 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.82 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.46 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.46 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.43 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.16 
 
 
427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 
426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 
425 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
427 aa  302  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 
426 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 
429 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 
422 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.49 
 
 
427 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
428 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.32 
 
 
430 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.07 
 
 
424 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 
426 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
420 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.2 
 
 
433 aa  300  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 
429 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.72 
 
 
429 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>